Theo Ban tổ chức, sau khi thống nhất, các đội tuyển quốc gia sẽ tập trung và thi đấu cọ xát từ ngày 20/12/2020. Tuy nhiên, trước diễn biến phức tạp của dịch Covid-19, các đội tuyển quốc gia sẽ không thể tập trung vào cùng thời điểm để thi đấu mà chia thành hai đợt.
Cụ thể, đợt 1 (từ ngày 20/12/2020 đến ngày 24/12/2020) với các đội tuyển bóng đá nam Quốc gia và đội tuyển U22 quốc gia để thi đấu các giải U23 châu Á năm 2021 và các trận còn lại tại vòng loại bảng H môn bóng đá nữ Olympic Tokyo năm 2021.
Đợt 2 (từ ngày 25/12/2020 đến ngày 29/12/2020) với các đội tuyển bóng đá quốc gia còn lại, sẽ thi đấu vòng loại thứ hai Olympic Tokyo năm 2021.
Sau khi hoàn thành nhiệm vụ tại các giải bóng đá quốc tế năm 2021, các tuyển quốc gia sẽ trở lại tập trung tại các câu lạc bộ để thi đấu các giải trong nước.
Theo đó, các câu lạc bộ sẽ tập trung các cầu thủ từ ngày 21/12/2020 và kết thúc đợt tập trung vào cuối tháng 2/2021. Các Liên đoàn bóng đá quốc gia sẽ căn cứ vào số lượng các giải đấu trong nước để tính toán các giải đấu cho các đội tuyển quốc gia tập trung trong khoảng thời gian phù hợp từ ngày 21/12/2020 đến 31/12/2021.
Đối với môn bóng đá nam tại kỳ Thế vận hội Olympic Tokyo, Ban tổ chức đã lựa chọn các đội tuyển Olympic quốc gia từ vòng loại thứ hai trở đi. Tuy nhiên, do dịch Covid-19 diễn biến phức tạp, các trận đấu sẽ không được tổ chức như kế hoạch ban đầu.
Tại kỳ Thế vận hội Olympic Tokyo, các đội tuyển bóng đá quốc gia của Nhật Bản sẽ tham gia ở các bảng J, F, G và H.
Đối với môn bóng đá nữ tại kỳ Thế vận hội Olympic Tokyo, các đội tuyển Nhật Bản sẽ tham gia ở 5 bảng đấu, đồng thời các trận đấu sẽ diễn ra tại 4 địa điểm thi đấu, trong đó có 3 trận trong nước và 2 trận quốc tế.
Các đội tuyển nữ quốc gia sẽ thi đấu từ ngày 26/6/